Sàng lọc in silico các chất ức chế Mpro ở SAR-CoV-2 từ quả cà dại hoa trắng Solanum torvum Sw. Solanaceae

Abstract

Các biến thể SARS-CoV-2 mới làm gia tăng tình trạng lây nhiễm, đồng thời làm giảm hiệu quả của vaccine và thuốc điều trị. Quả Solanum torvum được chứng minh có tiềm năng kháng virus. Sàng lọc ảo nhằm tìm kiếm các hợp chất kháng SARS-CoV-2 từ quả S. torvum là con đường hiệu quả giúp tiết kiệm thời gian và chi phí. 91 chất đã được công bố có trong quả S. torvum được tiến hành docking trên protease chính M^pro (6LU7). 5 chất có điểm số docking tốt nhất là quercetin, torvanol A, rutin, acid clorogenic và acid 4-O-caffeoyl quinic. Mô phỏng động lực học phân tử (MD) trong
50 ns cho thấy quercetin và acid clorogenic có khả năng gắn kết tốt vào M^pro (DG_bind là −18,02 và −16,51 kcal/mol, tương ứng). Đánh giá ADMET cho thấy hai chất này ít độc tính và thích hợp dùng đường uống. Mô hình docking phân tử và mô phỏng MD đã xây dựng có khả năng sàng lọc tốt các chất ức chế M^pro, phù hợp với các nghiên cứu trước đây và có thể ứng dụng trong sàng lọc các hợp chất tự nhiên.

® 2023 Journal of Science and Technology - NTTU