Xây dựng mô hình Docking phân tử trên các thụ thể liên quan đến viêm

Abstract

Các thuốc kháng viêm steroid và không steroid được sử dụng trong điều trị viêm thông qua việc ức chế các hợp chất trung gian. Tuy nhiên, việc sử dụng các thuốc kháng viêm dễ gây tác dụng phụ trên dạ dày, thận và gan. Để tìm hiểu về cơ chế ức chế viêm và hạn chế tác dụng có hại, nghiên cứu tiến hành xây dựng bộ mô hình docking phân tử có khả năng dự đoán đích tác động của các chất kháng viêm tiềm năng. Các thụ thể liên quan đến viêm được lựa chọn thuộc ba con đường truyền tín hiệu phổ biến bao gồm chuyển hóa acid arachidonic, MAPK, TLR/MyD88/NF-κB và các interleukin. Phương pháp docking phân tử được thực hiện bằng phần mềm AutoDock Vina 1.1.2. Kết quả cho thấy khoang gắn kết của 15 thụ thể viêm có khả năng mô phỏng tốt được xác định dựa vào chứng dương (∆G_dock < -6 kcal/mol, RMSD < 2 Å, và/hoặc tương tác cao với các acid amin quan trọng đã được công bố trước đó). Bộ mô hình docking phân tử là tiền đề cho việc sàng lọc đích tác động cụ thể của các chất kháng viêm mới. Từ đó, cơ chế tác động, tương tác thuốc liên quan thụ thể, cũng được làm sáng rõ, giúp giảm thiểu tác dụng phụ, tăng tác dụng kháng viêm của các hợp chất tiềm năng.