Phát hiện và phân tích đặc điểm di truyền đoạn gen mã hoá protein cấu trúc của virus PPV3 (Porcine Parvovirus 3) trên lợn giết mổ nuôi tại tỉnh Tây Ninh

Abstract

Porcine Parvovirus (PPV) là nguyên nhân chính gây hội chứng suy giảm khả năng sinh sản ở lợn. Nghiên cứu này nhằm phát hiện và phân tích đặc điểm di truyền của PPV3 lưu hành trên lợn ở độ tuổi giết mổ nuôi tại tỉnh Tây Ninh. Virus được phát hiện bằng kỹ thuật PCR với cặp mồi đặc hiệu và giải trình tự đoạn gen mã hóa protein cấu trúc (gen VP). Kết quả PCR cho thấy sự hiện diện của vật liệu di truyền đặc hiệu của PPV3 trong 54/128 mẫu nghiên cứu, với tỷ lệ 42,2%. Trình tự nucleotide của đoạn gen VP có kích thước phân tử 326 bp từ hai chủng PPV3-TN16 và PPV3-TN24 đã được xác định và đăng ký vào GenBank với mã truy nhập PV702865 và PV702866. Phân tích BLAST cho thấy các trình tự này có độ tương đồng cao với các chủng PPV3 có nguồn gốc từ Trung Quốc. Phân tích phát sinh chủng loại cho thấy hai chủng phát hiện tại Tây Ninh có quan hệ di truyền gần gũi với các chủng PPV3 châu Á. Mặc dù đoạn gen giải trình tự có kích thước ngắn, nghiên cứu này đã cung cấp bằng chứng phân tử đầu tiên về sự lưu hành và đặc điểm di truyền của PPV3 tại Tây Ninh, làm cơ sở cho các nghiên cứu sâu hơn về dịch tễ học phân tử và chiến lược kiểm soát bệnh do PPVs gây ra.